A Helyi Bizottságok gazdaságilag önálló szervezeti egységei az Egyesületnek, a tagok tevékenysége közvetlenül a HB-k által valósul meg. A Mafihe jelenleg öt helyi bizottságra tagozódik, egy-egy működik a Debreceni Egyetemen, a Pécsi Tudományegyetemen és a Szegedi Tudományegyetemen, míg Budapesten kettő: a Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetemen és az Eötvös Loránd Tudományegyetemen.